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创新团队

  

农业基因组学技术研发与应用创新团队


首席科学家阮珏


团队构成阮珏课题组常玉晓课题组崔鹏课题组徐炜课题组张兴坦课题组邵浩靖课题组纪宏超课题组陈琦翩课题组樊伟课题组潘玮华课题组


研究方向: 研发组学算法和测序方法,致力于解决基因组学及其他组学研究中核心方法学问题。


研究成绩:团队开发了三代测序数据组装的主流算法软件 SMARTdenovo 和 WTDBG ;开发出最佳平衡准确度的体细胞结构变异检测算法 NovoBreak ;在低频突变检测上,连续开发了 Droplet-CirSeq、O2N-seq、 微量DNA扩增等技术,将二代测序错误率从10-2-10-3水平降低至10-5-10?8水平的同时,数据有效率提高10-30倍;建立了 ribominusRNA-seq (rmRNA-seq) 实验和分析方法,并应用到植物基因可变剪接和植物抗逆的研究;开发了 NSF-Mate Pair Library 技术加速大片段DNA文库构建。团队独立研发的组学技术以及与相关科研院所高校开展的组学技术合作项目成果先后发表在 Nature、Nature Genetics、Nature Methods、Nature Communications 等国际期刊,在农业基因组学技术研究领域产生重要的影响。团队先后承担了国家重点研发计划项目、国家优秀青年科学基金项目、国家自然科学基金面上及青年基金项目等国家级科研项目。


更新于2025年6月


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